Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp6v0e1Q9CQD8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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