Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
4921530L21RikQ9CQ47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4921530L21RikQ9CQ47 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4921530L21RikQ9CQ47 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4921530L21RikQ9CQ47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms