Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
StambpQ9CQ26 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
StambpQ9CQ26 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
StambpQ9CQ26 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
StambpQ9CQ26 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
StambpQ9CQ26 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
StambpQ9CQ26 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
StambpQ9CQ26 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms