Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdk2ap2Q9CPY4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk2ap2Q9CPY4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk2ap2Q9CPY4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdk2ap2Q9CPY4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdk2ap2Q9CPY4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk2ap2Q9CPY4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms