Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox6cQ9CPQ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox6cQ9CPQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox6cQ9CPQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox6cQ9CPQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox6cQ9CPQ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox6cQ9CPQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms