Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim8Q99PJ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim8Q99PJ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim8Q99PJ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim8Q99PJ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim8Q99PJ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim8Q99PJ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim8Q99PJ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim8Q99PJ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim8Q99PJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim8Q99PJ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim8Q99PJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim8Q99PJ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim8Q99PJ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms