Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RetnQ99P87 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RetnQ99P87 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RetnQ99P87 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RetnQ99P87 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RetnQ99P87 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RetnQ99P87 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RetnQ99P87 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RetnQ99P87 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RetnQ99P87 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RetnQ99P87 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms