Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc26a5Q99NH7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc26a5Q99NH7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc26a5Q99NH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc26a5Q99NH7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc26a5Q99NH7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc26a5Q99NH7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc26a5Q99NH7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc26a5Q99NH7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc26a5Q99NH7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc26a5Q99NH7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a5Q99NH7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a5Q99NH7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc26a5Q99NH7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a5Q99NH7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc26a5Q99NH7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc26a5Q99NH7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc26a5Q99NH7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc26a5Q99NH7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc26a5Q99NH7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc26a5Q99NH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc26a5Q99NH7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms