Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep41Q99NF3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep41Q99NF3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep41Q99NF3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cep41Q99NF3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep41Q99NF3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cep41Q99NF3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cep41Q99NF3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms