Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pcgf6Q99NA9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pcgf6Q99NA9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Pcgf6Q99NA9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pcgf6Q99NA9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pcgf6Q99NA9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Pcgf6Q99NA9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Pcgf6Q99NA9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pcgf6Q99NA9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pcgf6Q99NA9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pcgf6Q99NA9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pcgf6Q99NA9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pcgf6Q99NA9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pcgf6Q99NA9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pcgf6Q99NA9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pcgf6Q99NA9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pcgf6Q99NA9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pcgf6Q99NA9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pcgf6Q99NA9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Pcgf6Q99NA9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pcgf6Q99NA9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pcgf6Q99NA9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Pcgf6Q99NA9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pcgf6Q99NA9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pcgf6Q99NA9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pcgf6Q99NA9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pcgf6Q99NA9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pcgf6Q99NA9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pcgf6Q99NA9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Pcgf6Q99NA9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Pcgf6Q99NA9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcgf6Q99NA9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcgf6Q99NA9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pcgf6Q99NA9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pcgf6Q99NA9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pcgf6Q99NA9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pcgf6Q99NA9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pcgf6Q99NA9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pcgf6Q99NA9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pcgf6Q99NA9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pcgf6Q99NA9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pcgf6Q99NA9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pcgf6Q99NA9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Pcgf6Q99NA9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pcgf6Q99NA9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pcgf6Q99NA9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pcgf6Q99NA9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pcgf6Q99NA9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pcgf6Q99NA9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms