Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a6dQ99N07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ms4a6dQ99N07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a6dQ99N07 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a6dQ99N07 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ms4a6dQ99N07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a6dQ99N07 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a6dQ99N07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms