Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SrrtQ99MR6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SrrtQ99MR6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SrrtQ99MR6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SrrtQ99MR6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SrrtQ99MR6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SrrtQ99MR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SrrtQ99MR6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SrrtQ99MR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SrrtQ99MR6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SrrtQ99MR6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SrrtQ99MR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SrrtQ99MR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SrrtQ99MR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SrrtQ99MR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SrrtQ99MR6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SrrtQ99MR6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SrrtQ99MR6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SrrtQ99MR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SrrtQ99MR6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SrrtQ99MR6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SrrtQ99MR6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms