Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsl24d1Q99L28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsl24d1Q99L28 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsl24d1Q99L28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsl24d1Q99L28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rsl24d1Q99L28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rsl24d1Q99L28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rsl24d1Q99L28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsl24d1Q99L28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsl24d1Q99L28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsl24d1Q99L28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms