Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TriobpQ99KW3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TriobpQ99KW3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TriobpQ99KW3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TriobpQ99KW3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TriobpQ99KW3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TriobpQ99KW3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TriobpQ99KW3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TriobpQ99KW3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TriobpQ99KW3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TriobpQ99KW3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TriobpQ99KW3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TriobpQ99KW3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TriobpQ99KW3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TriobpQ99KW3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TriobpQ99KW3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TriobpQ99KW3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TriobpQ99KW3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TriobpQ99KW3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TriobpQ99KW3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TriobpQ99KW3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TriobpQ99KW3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TriobpQ99KW3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TriobpQ99KW3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TriobpQ99KW3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TriobpQ99KW3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TriobpQ99KW3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TriobpQ99KW3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TriobpQ99KW3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TriobpQ99KW3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TriobpQ99KW3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TriobpQ99KW3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TriobpQ99KW3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TriobpQ99KW3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TriobpQ99KW3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TriobpQ99KW3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TriobpQ99KW3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TriobpQ99KW3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TriobpQ99KW3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms