Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krcc1Q99JT5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krcc1Q99JT5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krcc1Q99JT5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krcc1Q99JT5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krcc1Q99JT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krcc1Q99JT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krcc1Q99JT5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krcc1Q99JT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krcc1Q99JT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krcc1Q99JT5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krcc1Q99JT5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krcc1Q99JT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms