Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef1Q99JL1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spef1Q99JL1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spef1Q99JL1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef1Q99JL1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spef1Q99JL1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spef1Q99JL1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spef1Q99JL1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spef1Q99JL1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef1Q99JL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spef1Q99JL1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spef1Q99JL1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spef1Q99JL1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms