Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Def8Q99J78 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Def8Q99J78 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Def8Q99J78 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Def8Q99J78 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Def8Q99J78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Def8Q99J78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Def8Q99J78 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Def8Q99J78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Def8Q99J78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Def8Q99J78 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Def8Q99J78 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Def8Q99J78 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Def8Q99J78 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Def8Q99J78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Def8Q99J78 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Def8Q99J78 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Def8Q99J78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Def8Q99J78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms