Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd1Q99J36 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd1Q99J36 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd1Q99J36 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Thumpd1Q99J36 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Thumpd1Q99J36 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thumpd1Q99J36 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd1Q99J36 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thumpd1Q99J36 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thumpd1Q99J36 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms