Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim7Q923T7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim7Q923T7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim7Q923T7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim7Q923T7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim7Q923T7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim7Q923T7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim7Q923T7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim7Q923T7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim7Q923T7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim7Q923T7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim7Q923T7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim7Q923T7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim7Q923T7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim7Q923T7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms