Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TardbpQ921F2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TardbpQ921F2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TardbpQ921F2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TardbpQ921F2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TardbpQ921F2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TardbpQ921F2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TardbpQ921F2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TardbpQ921F2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TardbpQ921F2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TardbpQ921F2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TardbpQ921F2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TardbpQ921F2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TardbpQ921F2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TardbpQ921F2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TardbpQ921F2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms