Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin3bQ91ZU9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin3bQ91ZU9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin3bQ91ZU9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin3bQ91ZU9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin3bQ91ZU9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin3bQ91ZU9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin3bQ91ZU9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin3bQ91ZU9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin3bQ91ZU9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grin3bQ91ZU9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin3bQ91ZU9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin3bQ91ZU9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grin3bQ91ZU9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin3bQ91ZU9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Grin3bQ91ZU9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin3bQ91ZU9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin3bQ91ZU9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Grin3bQ91ZU9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin3bQ91ZU9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Grin3bQ91ZU9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Grin3bQ91ZU9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Grin3bQ91ZU9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Grin3bQ91ZU9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin3bQ91ZU9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms