Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf6Q91YR7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prpf6Q91YR7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prpf6Q91YR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prpf6Q91YR7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prpf6Q91YR7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prpf6Q91YR7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prpf6Q91YR7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prpf6Q91YR7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prpf6Q91YR7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prpf6Q91YR7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Prpf6Q91YR7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prpf6Q91YR7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prpf6Q91YR7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prpf6Q91YR7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prpf6Q91YR7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prpf6Q91YR7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prpf6Q91YR7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Prpf6Q91YR7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prpf6Q91YR7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.5 ms