Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ7

Rmnd5b, Protein RMD5 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmnd5bQ91YQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rmnd5bQ91YQ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rmnd5bQ91YQ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rmnd5bQ91YQ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rmnd5bQ91YQ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rmnd5bQ91YQ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rmnd5bQ91YQ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rmnd5bQ91YQ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rmnd5bQ91YQ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rmnd5bQ91YQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rmnd5bQ91YQ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rmnd5bQ91YQ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rmnd5bQ91YQ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rmnd5bQ91YQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rmnd5bQ91YQ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rmnd5bQ91YQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rmnd5bQ91YQ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rmnd5bQ91YQ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmnd5bQ91YQ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmnd5bQ91YQ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rmnd5bQ91YQ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rmnd5bQ91YQ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rmnd5bQ91YQ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rmnd5bQ91YQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmnd5bQ91YQ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmnd5bQ91YQ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmnd5bQ91YQ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rmnd5bQ91YQ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmnd5bQ91YQ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmnd5bQ91YQ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmnd5bQ91YQ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmnd5bQ91YQ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmnd5bQ91YQ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmnd5bQ91YQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rmnd5bQ91YQ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms