Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atl3Q91YH5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atl3Q91YH5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Atl3Q91YH5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atl3Q91YH5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atl3Q91YH5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atl3Q91YH5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Atl3Q91YH5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atl3Q91YH5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atl3Q91YH5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atl3Q91YH5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Atl3Q91YH5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atl3Q91YH5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atl3Q91YH5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Atl3Q91YH5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atl3Q91YH5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atl3Q91YH5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Atl3Q91YH5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Atl3Q91YH5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms