Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcdhb12Q91Y07 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcdhb12Q91Y07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcdhb12Q91Y07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pcdhb12Q91Y07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcdhb12Q91Y07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcdhb12Q91Y07 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcdhb12Q91Y07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcdhb12Q91Y07 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcdhb12Q91Y07 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcdhb12Q91Y07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcdhb12Q91Y07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcdhb12Q91Y07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcdhb12Q91Y07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcdhb12Q91Y07 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcdhb12Q91Y07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcdhb12Q91Y07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pcdhb12Q91Y07 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pcdhb12Q91Y07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcdhb12Q91Y07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pcdhb12Q91Y07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pcdhb12Q91Y07 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pcdhb12Q91Y07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdhb12Q91Y07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcdhb12Q91Y07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pcdhb12Q91Y07 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcdhb12Q91Y07 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcdhb12Q91Y07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcdhb12Q91Y07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcdhb12Q91Y07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcdhb12Q91Y07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcdhb12Q91Y07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcdhb12Q91Y07 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms