Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ9

Pcdhb20, Protocadherin beta 20, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb20Q91XZ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb20Q91XZ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcdhb20Q91XZ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb20Q91XZ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdhb20Q91XZ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdhb20Q91XZ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb20Q91XZ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdhb20Q91XZ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdhb20Q91XZ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdhb20Q91XZ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdhb20Q91XZ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdhb20Q91XZ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdhb20Q91XZ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdhb20Q91XZ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb20Q91XZ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb20Q91XZ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms