Protein–RNA interactions for Protein: Q91WV7

Slc3a1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc3a1Q91WV7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc3a1Q91WV7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc3a1Q91WV7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc3a1Q91WV7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc3a1Q91WV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc3a1Q91WV7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc3a1Q91WV7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc3a1Q91WV7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc3a1Q91WV7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc3a1Q91WV7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc3a1Q91WV7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc3a1Q91WV7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms