Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Nlrp6Q91WS2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nlrp6Q91WS2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nlrp6Q91WS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nlrp6Q91WS2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nlrp6Q91WS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nlrp6Q91WS2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nlrp6Q91WS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nlrp6Q91WS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nlrp6Q91WS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nlrp6Q91WS2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nlrp6Q91WS2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nlrp6Q91WS2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nlrp6Q91WS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Nlrp6Q91WS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nlrp6Q91WS2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nlrp6Q91WS2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nlrp6Q91WS2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nlrp6Q91WS2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nlrp6Q91WS2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nlrp6Q91WS2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nlrp6Q91WS2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nlrp6Q91WS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nlrp6Q91WS2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nlrp6Q91WS2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nlrp6Q91WS2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Nlrp6Q91WS2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nlrp6Q91WS2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Nlrp6Q91WS2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nlrp6Q91WS2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nlrp6Q91WS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Nlrp6Q91WS2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Nlrp6Q91WS2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nlrp6Q91WS2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nlrp6Q91WS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nlrp6Q91WS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Nlrp6Q91WS2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Nlrp6Q91WS2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Nlrp6Q91WS2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Nlrp6Q91WS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Nlrp6Q91WS2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Nlrp6Q91WS2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Nlrp6Q91WS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nlrp6Q91WS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nlrp6Q91WS2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Nlrp6Q91WS2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Nlrp6Q91WS2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Nlrp6Q91WS2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms