Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce2Q91VT1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce2Q91VT1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsmce2Q91VT1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsmce2Q91VT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsmce2Q91VT1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsmce2Q91VT1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsmce2Q91VT1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nsmce2Q91VT1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nsmce2Q91VT1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nsmce2Q91VT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nsmce2Q91VT1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nsmce2Q91VT1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nsmce2Q91VT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms