Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TraipQ8VIG6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TraipQ8VIG6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TraipQ8VIG6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TraipQ8VIG6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TraipQ8VIG6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TraipQ8VIG6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TraipQ8VIG6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TraipQ8VIG6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TraipQ8VIG6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TraipQ8VIG6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TraipQ8VIG6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TraipQ8VIG6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TraipQ8VIG6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TraipQ8VIG6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TraipQ8VIG6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TraipQ8VIG6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TraipQ8VIG6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TraipQ8VIG6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TraipQ8VIG6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms