Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PxnQ8VI36 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PxnQ8VI36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PxnQ8VI36 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PxnQ8VI36 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PxnQ8VI36 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PxnQ8VI36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PxnQ8VI36 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PxnQ8VI36 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PxnQ8VI36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PxnQ8VI36 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PxnQ8VI36 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PxnQ8VI36 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PxnQ8VI36 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PxnQ8VI36 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PxnQ8VI36 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PxnQ8VI36 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PxnQ8VI36 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PxnQ8VI36 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms