Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc115Q8VE99 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc115Q8VE99 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc115Q8VE99 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc115Q8VE99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc115Q8VE99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc115Q8VE99 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc115Q8VE99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc115Q8VE99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms