Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paip1Q8VE62 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paip1Q8VE62 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paip1Q8VE62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Paip1Q8VE62 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Paip1Q8VE62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paip1Q8VE62 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Paip1Q8VE62 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Paip1Q8VE62 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Paip1Q8VE62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Paip1Q8VE62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Paip1Q8VE62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Paip1Q8VE62 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Paip1Q8VE62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paip1Q8VE62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Paip1Q8VE62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Paip1Q8VE62 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Paip1Q8VE62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms