Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc92Q8VDN4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc92Q8VDN4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc92Q8VDN4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc92Q8VDN4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc92Q8VDN4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc92Q8VDN4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc92Q8VDN4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc92Q8VDN4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms