Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1Q8VDF2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1Q8VDF2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1Q8VDF2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uhrf1Q8VDF2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uhrf1Q8VDF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Uhrf1Q8VDF2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uhrf1Q8VDF2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uhrf1Q8VDF2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Uhrf1Q8VDF2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1Q8VDF2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uhrf1Q8VDF2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uhrf1Q8VDF2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uhrf1Q8VDF2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Uhrf1Q8VDF2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uhrf1Q8VDF2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uhrf1Q8VDF2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Uhrf1Q8VDF2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Uhrf1Q8VDF2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Uhrf1Q8VDF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Uhrf1Q8VDF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
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