Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc9Q8VC31 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc9Q8VC31 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc9Q8VC31 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc9Q8VC31 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc9Q8VC31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc9Q8VC31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Ccdc9Q8VC31 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc9Q8VC31 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc9Q8VC31 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc9Q8VC31 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc9Q8VC31 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc9Q8VC31 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc9Q8VC31 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc9Q8VC31 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc9Q8VC31 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ccdc9Q8VC31 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc9Q8VC31 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc9Q8VC31 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc9Q8VC31 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc9Q8VC31 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc9Q8VC31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc9Q8VC31 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc9Q8VC31 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc9Q8VC31 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc9Q8VC31 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc9Q8VC31 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc9Q8VC31 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc9Q8VC31 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc9Q8VC31 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc9Q8VC31 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc9Q8VC31 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc9Q8VC31 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms