Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MpdzQ8VBX6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MpdzQ8VBX6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MpdzQ8VBX6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MpdzQ8VBX6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MpdzQ8VBX6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MpdzQ8VBX6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MpdzQ8VBX6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.3 ms