Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BbxQ8VBW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BbxQ8VBW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BbxQ8VBW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BbxQ8VBW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BbxQ8VBW5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BbxQ8VBW5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BbxQ8VBW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BbxQ8VBW5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BbxQ8VBW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BbxQ8VBW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BbxQ8VBW5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BbxQ8VBW5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BbxQ8VBW5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BbxQ8VBW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BbxQ8VBW5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BbxQ8VBW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms