Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RttnQ8R4Y8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RttnQ8R4Y8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RttnQ8R4Y8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RttnQ8R4Y8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RttnQ8R4Y8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RttnQ8R4Y8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RttnQ8R4Y8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms