Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Slf1Q8R3P9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slf1Q8R3P9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slf1Q8R3P9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf1Q8R3P9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slf1Q8R3P9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf1Q8R3P9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slf1Q8R3P9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slf1Q8R3P9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slf1Q8R3P9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slf1Q8R3P9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slf1Q8R3P9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slf1Q8R3P9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slf1Q8R3P9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf1Q8R3P9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf1Q8R3P9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf1Q8R3P9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms