Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RorbQ8R1B8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RorbQ8R1B8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RorbQ8R1B8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RorbQ8R1B8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RorbQ8R1B8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RorbQ8R1B8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RorbQ8R1B8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RorbQ8R1B8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RorbQ8R1B8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms