Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcsapQ8QZT2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CcsapQ8QZT2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CcsapQ8QZT2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CcsapQ8QZT2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CcsapQ8QZT2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CcsapQ8QZT2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CcsapQ8QZT2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcsapQ8QZT2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcsapQ8QZT2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcsapQ8QZT2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CcsapQ8QZT2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcsapQ8QZT2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcsapQ8QZT2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms