Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StradbQ8K4T3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
StradbQ8K4T3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
StradbQ8K4T3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
StradbQ8K4T3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
StradbQ8K4T3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
StradbQ8K4T3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
StradbQ8K4T3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
StradbQ8K4T3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
StradbQ8K4T3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
StradbQ8K4T3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
StradbQ8K4T3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
StradbQ8K4T3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms