Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J0

Dclre1c, Protein artemis, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1cQ8K4J0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclre1cQ8K4J0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1cQ8K4J0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Dclre1cQ8K4J0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclre1cQ8K4J0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclre1cQ8K4J0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclre1cQ8K4J0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dclre1cQ8K4J0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclre1cQ8K4J0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms