Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc3Q8K3W3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc3Q8K3W3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc3Q8K3W3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc3Q8K3W3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc3Q8K3W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc3Q8K3W3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc3Q8K3W3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms