Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HscbQ8K3A0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HscbQ8K3A0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HscbQ8K3A0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HscbQ8K3A0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HscbQ8K3A0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HscbQ8K3A0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HscbQ8K3A0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HscbQ8K3A0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HscbQ8K3A0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms