Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx52Q8K301 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx52Q8K301 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx52Q8K301 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx52Q8K301 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx52Q8K301 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx52Q8K301 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx52Q8K301 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx52Q8K301 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx52Q8K301 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx52Q8K301 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddx52Q8K301 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx52Q8K301 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddx52Q8K301 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx52Q8K301 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddx52Q8K301 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms