Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnot3Q8K0V4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnot3Q8K0V4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnot3Q8K0V4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnot3Q8K0V4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cnot3Q8K0V4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnot3Q8K0V4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot3Q8K0V4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot3Q8K0V4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms