Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LgsnQ8CIX8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LgsnQ8CIX8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LgsnQ8CIX8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LgsnQ8CIX8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LgsnQ8CIX8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LgsnQ8CIX8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LgsnQ8CIX8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LgsnQ8CIX8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LgsnQ8CIX8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LgsnQ8CIX8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms