Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Card11Q8CIS0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Card11Q8CIS0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Card11Q8CIS0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Card11Q8CIS0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Card11Q8CIS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Card11Q8CIS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Card11Q8CIS0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Card11Q8CIS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Card11Q8CIS0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Card11Q8CIS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Card11Q8CIS0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Card11Q8CIS0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Card11Q8CIS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Card11Q8CIS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Card11Q8CIS0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Card11Q8CIS0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Card11Q8CIS0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Card11Q8CIS0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Card11Q8CIS0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Card11Q8CIS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Card11Q8CIS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Card11Q8CIS0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Card11Q8CIS0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Card11Q8CIS0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Card11Q8CIS0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Card11Q8CIS0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Card11Q8CIS0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Card11Q8CIS0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Card11Q8CIS0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Card11Q8CIS0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Card11Q8CIS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Card11Q8CIS0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Card11Q8CIS0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Card11Q8CIS0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Card11Q8CIS0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Card11Q8CIS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Card11Q8CIS0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Card11Q8CIS0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Card11Q8CIS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Card11Q8CIS0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Card11Q8CIS0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Card11Q8CIS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Card11Q8CIS0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Card11Q8CIS0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Card11Q8CIS0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Card11Q8CIS0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Card11Q8CIS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Card11Q8CIS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Card11Q8CIS0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Card11Q8CIS0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Card11Q8CIS0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Card11Q8CIS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Card11Q8CIS0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Card11Q8CIS0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Card11Q8CIS0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Card11Q8CIS0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Card11Q8CIS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Card11Q8CIS0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms